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タンパク質の「Hydrophobic Moment値」について
現在、生体たんぱく質のカルモデュリンを研究室で扱っており、これが他のタンパク質と結合する際に、どの位置のアミノ酸残基が結合するか、またどのようなモチーフを持つか、というプログラムを作っています。 Calmodulin Target Databaseという既存のものが存在するのですが、それによる検索の条件の一つに、「Hydrophobic Moment」という値があります。 アミノ酸の持つこの値を知りたいのですが、聞いたことがありません。 もし知っておられる人がいましたら、お教えください。 よろしくお願いします。
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内容については専門ではありませんが、ちょっとした検索のコツという事で、回答とさせて頂きます。 英文で直接検索しても、引っ掛かってくる物ですよ。 日本のサイトでダメなら、USAかUKのサイトで見ます。 たとえば、以下URLのように出てきますね。 84年の文献ならば、JOISでも探せると思います。 Hydrophobic moment was described by Eisenberg (Eisenberg et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81; 140-144 (1984)).
お礼
お礼が大変遅くなってしまいまして申し訳ございません。言われた通り、直接入力しても引っかかるものだという事が分かりました。 検索の方法を色々考えたいと思います。ありがとうございました。