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【緊急】 ブタフル

ブタフルの検出において最終段階のシーケンシング法のひとつ前の方法をメディアで PCR「法」と呼んでいたのでずっと奇異に思っていたのですが、もしかしてプライマにブタフルの特異配列 2 種を使っているという意味なのでしょうか。 想像ではなく、実際に国 (というより国立感染症研究所、ないし WHO) によって決められたプロトコルによりブタフルの PCR - 電気泳動法による同定に関わっている方、お願いします。

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noname#160718
noname#160718
回答No.1

 実際に検査業務に従事している者でなくて申し訳ないですが、従事している人がこんな時期にこんなサイトに書き込むヒマがあるとはとても思えないので、何度質問を削除して投稿し直しても同じだと思いますよ。  一応獣医師でウイルスに専門知識を有する者です。検査をやれと言われたら、すぐにでもできるだけの知識と技術は持っています。  厚労省の「病原体検出マニュアル」というものがあります。 http://www.nih.go.jp/niid/reference/pathogen-manual-60.pdf  1469ページもある膨大なマニュアルですが、その853-895ページまでがインフルエンザの項目です。  この中でPCR関連は878-882ページです。このくらいは読んでいて理解している上で質問している、と理解してよろしいですか?  さて、今回の新型に関しては、こんな文書が出ています。 http://www.kenkou.pref.mie.jp/topic/influ/pandemic_influ/siryou01/KentaiSoufu090504.pdf  ま、ここに書かれている「病原体検出マニュアル 新型インフルエンザ(H1N1)」そのものについては、私は入手する立場にないので知りませんが、概要はこの文書に書かれているまま素直に読めば良いでしょう。  さて、私もこの質問については奇異に思っています。  まず第一点。  「ブタフル」と表現されていますが、これは「新型インフルエンザ」の間違いですよね?豚インフルエンザは豚の病気、新型インフルエンザはヒトの病気です。新型は発生当初、豚由来だとされたので"豚インフルエンザ"と呼ばれていましたが、ヒト→ヒト感染を繰り返して世界的な流行を起こす危険性が高まった時点で「新型インフルエンザ」と呼ばれ直されました。  というのも、「豚インフルエンザ」の診断マニュアルもちゃんと存在するんですよ。もちろん豚の病気としての豚インフルエンザですが。  よもやそちらの方を質問しているのではないと思うので、新型の話として回答していますが、混同を避けるためにも、今後は正しい呼称を飼養して頂ければと思います。  次に、 >PCR「法」と呼んでいたのでずっと奇異に思っていたのですが  ここも理解できません。「法」が付こうが付くまいが、PCRはPCRです。 >プライマにブタフルの特異配列 2 種を使っているという意味なのでしょうか  ここもよく判らないのですが、報道を見ていれば国内初感染が摘発された時期では、地方衛研で実施されているPCRでは「H1かH3のどちらか」しか判らない、とされていたことはお判りでしょう。  と言うことは必然的に、H1のプライマーは豚インフルエンザウイルス特異的ではなく、H1亜型全般にヒットするものだったことは自明の理だと思いますが。  その後、上に挙げた厚労省通達によれば、今回の新型インフルエンザウイルスのH1領域に特異的にアニールするプライマーが配布(またはシークエンスが公表)された、ということでしょう。  まあ、病原体検出マニュアルに載っているH1検出プライマーですが、公開されている新型インフルエンザウイルスのH1領域のシークエンスと比較してみればお判りかと思いますが、普通に走ると思います。 >ブタフルの PCR - 電気泳動法による同定に関わっている方  国内初感染が報道された頃、NHKの特集で検査法についてかなり詳しく報道されていました。  このTV番組では埼玉県の衛研でH亜型同定まで検査室にカメラが入って放映されていたのですが、ここの衛研ではReal-Time PCRで検査を実施していました。この番組を見る限りでは、H1とH3をマルチプレックスで検出していたようですね。  まあ、今時の衛研でリアルタイムの機器が未導入というところもほとんどないでしょうから、実際は大半の都道府県でリアルタイムPCRにより検査が行われているということでしょう。  つまり、電気泳動はしていない、ということです。  結局のところ、何を「奇異」に感じたか、私には判らないのですが?

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お礼

正解が出ないようですので、いったん質問を閉じます。

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