内部監査について

質問

こんにちは。
内部監査について質問させてください。

先日当社に内部監査が入りました。
しかもその監査がうちの部署を狙い打ちしてきたそうです。
つまりうちの部署の誰かが密告したんだと思います。

といいますのも…
うちの部署はサービス残業が横行しているのです。
月100時間の時間外に対して、支払われるのは40時間程度…
誰かが密告してもおかしくない状況だと思います。
私も監査室か労基に密告しようかと考えていました。

話は戻りますが、、
内部監査が入り、時間外について調べているっぽいです。
上司が慌ただしく過去の時間外申請シートなどを調べているので。

まあ時間外申請シートを調べたところで何の意味も無いのですが。

実際に調べて欲しいのは、IDカードの入退室時間です。
これを調べてもらえれば実際に会社にいた時間が分かります。

まだIDカードまでは調べられていないのですが、今後調べられる可能性はあるのでしょうか？
そして調べてサービス残業が発覚した場合は未払い分は戻ってくるのでしょうか？

内部監査の経験がある方いらっしゃいましたら教えて下さい。

日本語めちゃくちゃですいません。

よろしくお願いします。