DNAシーケンス ジデオキシ法

質問

ジデオキシ法に用いるプライマーはどのように決定するのですか？
塩基配列を知りたいからシーケンスを行うのだから、鋳型DNAに特異的なプライマーを設計するのは無理な気がするのですが…
レベルの低い質問で恐縮ですが教えてください

回答No.1

MIYD · ベストアンサー

１．クローニングベクターに入れて、ベクターにアニールするプライマーを用いる
２．適当な配列をライゲーションして、そこにアニールするプライマーを用いる

一度、クローニングについて調べてみましょう。

補足

回答ありがとうございます。
よく分かりました。
クローニングについてもっと勉強してみます。

回答No.3

oil-sour

googleで一発目に出てくる記事ですが、わかりやすいです。
http://www.jpo.go.jp/shiryou/s_sonota/hyoujun_gijutsu/kakusan/0062.html

ジデオキシ法（サンガー法）についてはここを見ればよくわかるかとおもいます。
ちないに、まったく未知の領域をライブラリの中から見つけ出した後シークエンスを決定したい、という場合はライブラリベクター側の配列を使う訳です(いわゆるM13 primerなど）。

補足

回答ありがとうございます
M13よく本で見かけます。もっと自分で勉強するべきですね
頑張ります

回答No.2

tunertune

ターゲットがある程度分かっているのならば、そのターゲットに保存されている領域にプライマーを設計すればいいのでは？
そもそもシークエンス用にPCRを使うのであれば、PCRに使ったプライマーでシークエンスすればいいのでは？

補足

回答ありがとうございます。
よく分かりました。