「発電負荷が上がるとか、エンジン回転の抵抗が大きくなる」というような
心配は無用です。
車に必要な電力は、その車の電気負荷で決まります。
電気負荷とは、電気で動く部品、例えばインジェクタ、ナビ、ランプなど全てです。
これらの部品は全て、消費する電力（作動させるのに必要な電流）が決まっており、
容量の大きいオルタネータに替えたからたくさんの電流を食うようになるということは
絶対にありません。
バッテリの充電電流が増えるからエンジンにかかる負荷が増えるという考えも理屈に
合いません。
満充電になれば充電は止まります。
容量の大きいオルタネータだからどんどん充電し続けるとなれば、バッテリが壊れて
しまいます。そうならないように、容量の大小にかかわらず発電電圧は同じレベルです。
しかし、容量UPすれば充電電流が増えて、充電時間が短くなるから早く満充電状態に
達するということは言えます。
実際問題として、出力100A品 を120A品 に替えたとしても、エンジントルクに
与える影響は微々たるものです。
もしかすると、効率がよくなってエンジントルクによい影響を及ぼすかもしれません。
２０A の差が出るのは、オルタネータの回転数で5－6000RPM 以上のときです。
もし、ほとんど常時、この高回転数で使用し、そして電気負荷も全部使用して１２０Aの
出力を出し続けているとすれば、エンジンにとっては、プラス２０A分のトルクを負担せねばならないことになります。
電気負荷が１００A以下なら、エンジンの負担は変わりません。
アイドルでは２，３A くらいの違いでしょう。
この２，３A の違いがバッテリの充電を速やかにする効果はあります。
バッテリの充電状態がよいということは、ランプに加わる電圧が少し高くなって
ランプが明るくなるという効果もあります。
オルタネータの容量（公称出力）は、100A,110A,120A・・・のように小刻みにUPして
いますが、大きさ（外径と長さ）は、ある範囲内の出力であれば同じ大きさです。
発電コイルの太さや巻数を変えて出力を変えているからです。
エンジンは、オルタネータの回転部分（ロータ）を回していますが、容量UPで
機械損が増えるということは、現実の問題にはなりませんね。
寒冷地仕様の場合、シートヒーターやデフォッガのような電熱負荷が大きいこと、
スタータ電流が大きいこと、したがって始動後のバッテリへの充電電流も大きい等により、
出力の大きいオルタネータを標準装備しています。
この場合は、電気負荷が寒冷地仕様以外の車に比べて大きいので、常時、発電量が大きくなって、エンジンの負担も大きくなります。
補足
詳しいご回答ありがとうございました。大変参考になりました。