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windows版 系統樹作成ソフトについて
現在大学の研究室で実験しており、系統樹を作りたいと思っています。mtDNAを用いて配列まではわかったのですが、それから先、系統樹をどのように作成すればいいのかお手上げ状態です。Mac用のソフトで他機関で作ったことはありますが、大学のPCはwindowsしかないため困っています。http://www.fifthdimension.jp/index.php?%B7%CF%C5%FD%B3%D8%2F%A5%BD%A5%D5%A5%C8%A5%A6%A5%A7%A5%A2 このサイトを見てはいるのですが、知識のないわたしは理解に苦しんでいます。立場上、お金のかからない方法を探しています。経験のある方、ご存知の方、助けてください。
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質問者が選んだベストアンサー
やはりclustalでalignmentをかけて、njplotで出力する、と言うのが一般的ではないでしょうか。 仕事柄、mac、win両方で系統樹を作成していますが、どちらでもclustalは使えます。njplotはclustalに同胞されています。 また、無根の形で出力したければPHYLIPを使うと便利です。一度出力したものをdraw系のソフトに持っていけば自由にmodifyすることができます。
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- water-cooled
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回答No.1
参考になるとよいのですが。
質問者
お礼
教えていただき、感謝しています！参考URLに早速行ってみました。挑戦してみますっ。
お礼
ありがとうございます！どれだけ個人で調べても、有効な情報はなかなか得られないもののようです・・・。回答してくださった文章の中には、やはり知らない言葉も多いですので、徹底的に調べてみようと思いました。改めまして、ありがとうございました。