化学の電気泳動についてお聞きします！

質問

電気泳動を制限酵素で処理しないプラスミドで行ったところ、バンドが2本確認できました。なぜ2本確認できたのでしょうか？

回答No.1

Dr_Hyper

plasmidは環状のため，ねじれが生じています。それをクローズドサーキュラー(CC)と言いますが，plasmidの精製時にplasmidに傷が入ると一部のねじれがとれてしまいます。それをオープンサーキュラー(OC)と言います。
電気泳動はアガロースという寒天がつくりだす網目のなかをこれらDNAを電気的に動かして邪魔される頻度で泳動度を変える技術なので，コンパクトにまとまったCCは早く流れ，緩んですこし広がったOCは遅れて泳動されます。
そのため普通に精製したplasmidはCCが濃くメインバンドで下に現れ，OCはそれよりも上方に弱く現れるのが一般的です。