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※ ChatGPTを利用し、要約された質問です(原文:nature(論文)の和訳添削のお願い(その17))

nature論文の和訳添削の依頼

このQ&Aのポイント
  • natureに掲載された論文の和訳添削依頼です。
  • 2.5 Gbのコンティグ配列と2.7Gbのスカフォールド配列を取得しました。
  • N50(またはN90)のコンティグサイズとは、最小のコンティグSの長さで、累積長さが50%以上(または90%以上)になるところまでのコンティグの累積長さです。

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noname#175206
noname#175206
回答No.1

>(1)We obtained 2.5 Gb (gigabase pairs) contig sequences with N50 19.3 kb (kilobase pairs) and N90 4.7 kb, and 2.7Gb scaffold sequences with N50 1.6Mb (megabase pairs) and N90 0.3 Mb. >(2)我々は、N50 19.3kd(キロベース:核酸連鎖の長さ?/キロベースペア)の配列を有する2.5GB(10の9乗)およびN90 4.7kb、そしてN50 1.6MbおよびN90 0.3Mbを有する2.7Gbの足場配列を得た。 「19.3kb(キロベースペア)の遺伝子N50と4.7kbの遺伝子N90を持つ2.5Gb(ギガベースペア)を伴うコンティグ(重複連続したクローン化DNAの集合体)配列、及び、1.6Mb(メガベースペア)のN50と0.3MbのN90を持つ、2.7Gbのスキャフォールド(染色体等の骨格構造)配列を得ることができた。」  base pairが塩基対ですが、それを長さの単位にしたのがbase-pairs(ベースペア)=bpです。  kb(p)で1000塩基対分、Mb(p)で100万塩基対分、Gb(p)で10億塩基対分の長さになります。 >(3)The N50 (or N90) contig size is the length of the smallest contig S in the sorted list of all contigs where the cumulative length from the largest contig to contig S is at least 50% (or 90%) of the total assembly length.) RNA-seq data (ageing and low O2 experiments) were for animals from the same colony. >(3)N50(あるいはN90)のコンティングサイズは,(検討した?)の全てのコンティング分類されたリストの最小コンティングSの長さである.最大のコンティングからコンティングSまでの累積長さが全アセンブリ長さの少なくとも50%(あるいは90%)だった. 「(最大のコンティグから最小のコンティグSまでの長さを足し合わせた長さが、最小でも全集合体の長さの50%(N90では90%)であるような、全てのコンティグをソートしてリストしてみると、N50(またはN90)のコンティグサイズは、最小であるコンティグSの長さと一致することが分かる。」  ここの"the total assembly"は「全集合体」としましたが、コンティグの組み合わさった集合体ではないかと思います。スキャフォールドのほうではないように思います。  でも他の可能性も含めて自信がないため、そこはぼやかしました(^^;。 >(4)See Supplementary Information for data analysis and additional details. >(4)参照:データ解析の捕捉情報および追加細部   いいと思います。 >(5)Received 14 June; accepted 5 September 2011. Published online 12 October 2011. >(5)受付:6月14日 受理:9月5日 オンライン出版:2011年10月12日  いいと思いますが、「オンライン出版」は「オンライン公開」でも大丈夫かと思います。  ようやく読み切りましたね。お疲れ様でした。  また面白い記事があれば、ご紹介してくださると嬉しいです。

kasudako
質問者

お礼

cozycube1さん ほんとうに長い間,丁寧な添削ありがとうございました. abstractにまとめさせてもらいます. 英語ばかりでなく,生化学の勉強にもなりました.  >また面白い記事があれば、ご紹介してくださると嬉しいです。 …そう言って頂けるとうれしいです.連休中には何か読み始めようと思っています. 是非,是非,宜しくお願いします.