ヒストグラムについて

質問

ある論文で、ES細胞において、多分化能を離脱して48時間後のmRNA発現量をマイクロアレイによって検出しヒストグラムで表示したというものがありました。

このヒストグラムの見方がよく分からないので詳しく教えてください。
画像が小さいのでPluripotency Factors in Embryonic Stem Cells Regulate Differentiation into Germ Layers(論文名)のFigure.2 Bを見ていただいた方が見やすいと思います。

よろしくお願いします。

回答No.3

guragura77 · ベストアンサー

＞つまり表の数値は、ヒストグラムの横軸の値に相当するという解釈でよろしいのでしょうか？

そうです。横軸も表も「48 hr / ES」です。

回答No.2

guragura77

ヒストグラムは処理前の ES 細胞と比べて 48時間後の細胞で mRNA 発現量が何倍に変化したかを示しています。横軸は変化の倍率で、縦軸は遺伝子数です。
ヒストグラムだけでは本文に書いてあるように、ほとんどの遺伝子の発現はあまり変化しなかったこと、2倍以上に変化したものの中で発現が減ったものの方が増えたものより多そうだということはわかるけど、特定の遺伝子の発現が増えたか減ったかはわかりません。だから表で個別に変動倍率を示しています。

ちゃんと本文読んでます？
よくわからない部分があっても全体を何度か読んでから改めてわからない部分を調べていった方が良いですよ。
CHIR も Experimental Procedures を見れば書いてあったわけですし、よく読みもせずに質問しているように感じられます。

補足

読みが浅かった気がします…
昨日あたりにCHIRについて書かれている文も見つけました(^^;)

つまり表の数値は、ヒストグラムの横軸の値に相当するという解釈でよろしいのでしょうか？

回答No.1

guragura77

なぜ真ん中に 0 があるのかわからないという事ですか？
横軸は 4 を底とした対数軸で数値は真数になっているみたいですが、真ん中は 4^0 だから 1 とすべきなのに 0 になってしまっています。うっかり間違えたんでしょう。

補足

横の数値とヒストグラムの関連性がよく分かりません。
統計系の知識が全くないので、基本的なところから理解しておりません。