アガロース電気泳動を塩基対が近いもの同士で行った場合

質問

アガロース電気泳動を塩基対が近いもの同士で行った場合

アガロース電気泳動ではDNA断片を長さによって分離することができます。
もし塩基対が近いもの同士(たとえば97bp、86bp)で行った場合
どのように確認すればいいのでょうか？

フラグメントサイズで確認することは可能でしょうか？
発光量で比較すればいいのでしょうか？

説明が下手で申し訳ありません。

回答No.2

otx

>発光量で比較するという方法もありますか？

無理です。

回答No.1

otx

ゲルにはそれぞれ　分離できる分子量が決まっています。
アガロースではそのような小さな違いは分離不可能と思います。
http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.asp?unitid=U100003518

アクリルアミドゲルで泳動する方法があります。
http://catalog.takara-bio.co.jp/product/ref_faq.asp?unitid=U100003525&masterid=M100003381

お礼

回答ありがとうございます。

ゲルにも種類があるんですね
知りませんでした。

発光量で比較するという方法もありますか？