細胞からRNAを抽出した時について質問があります！

質問

生化学の実験で細胞からRNAを抽出する時がありますよね。
その場合、細胞の中の核のRNAと一緒にミトコンドリアのRNAも抽出してしまうので細胞の中の核のRNAに特異的な実験は単純にはできないのでしょうか。
やはり、細胞画分で振り分けないといけないですよね？
ご回答お願い致します。

回答No.2

otx

>細胞からRNAを単純に抽出した際に核のRNAだけでなくミトコンドリアのRNAも抽出されてしまうのではないか

はい、その通りです。

＞細胞の中の核のRNAに特異的な実験

何を想定して問題になると思っていらっしゃるのか？と思いまして。
これまでRNAを使った実験を結構やっていますが、問題になるような実験とその目的ってあったか？と思いまして。

回答No.1

otx

まず、RNAはスプライシングと核膜外への輸送はかなりリンクしていることがわかってきています。
その上、あくまでmRNAの転写の場は細胞質です。

そのことから予想すると、核の中でスプライシングされた成熟mRNAがとどまる時間は短く、そして存在する量は少ないと思われます。

＞細胞画分で振り分けないといけないですよね？

核だけを分けたとして上記のような理由で解析できるか疑問です。
そして、細胞質は細胞分画する前にばらばらになりますので、細胞質にあるmRNAは集めることができません。

それ以前に、私は分画してRNAの実験をするって聞いたことありません。
「特異的な実験」って何かを言ってもらえれば知っているかもしれませんが。

補足

すみません。
質問の意味を誤解させてしまったようです。
質問では『細胞からRNAを単純に抽出した際に核のRNAだけでなくミトコンドリアのRNAも抽出されてしまうのではないか』という内容です。
誤解をさせてしまい、申し訳ありませんでした。
また、あまりにも基本的な質問で申し訳ありません。