医師の相続税調査について、詳しい方教えて下さい

質問

現在医師１名、看護師２名、事務員１名の小規模な診療所に勤務しております。

１８年度末に先生の奥さんが亡くなられて既に相続税を支払われたのですが、２０年度末に国税局から税務調査が診療所に入りました。（もちろん先生の自宅やお子さんの自宅にもですが）

調査は２～３日くらいだったと思います。
事前に調査が入る日も連絡がありました。

その際、１９年の１～３月あたりが窓口収入とレセプト収入の比率が合わないとチラッと言われたらしく帳簿を持って帰られました。
もちろん不正をしているわけではありませんが、地域密着型の町の小さな診療所ですので、「年金が入るまでは払えない」とか「今持ち合わせがないから・・」といった具合にツケにしていることも多々。
更に先生の知り合いや親せき等などからは窓口徴収せず保険請求のみすることもあったり、保険証を持ってこられず何十年と顔パスの患者さんが殆どなので、保険証確認がとれず月遅れ請求や保険証の資格がなくなってて返戻されたりすることもあります。
それで比率の誤差が生まれたのではないか・・？？と思うのですが、その辺りの質問も説明要求も特にされず、帳簿のみ持って帰られました。

あれから二か月経ちましたが特に音沙汰なし。

税務調査に入られたのが初めての経験なので、やましいことがあるわけではありませんが、「また急に調査されたりするのかな？」とか、「何か他に準備しておくべき書類等があるのかな？」とたまに考えてしまいます。

相続後、いつまで調査が続いて、いつ終了なのかが分からないので、何故だか私を含め先生と従業員みんなドキドキしております。
私が税金払うわけではないので関係ないと言われればそれまでですが、比率が合わないとか、奥さんが経営していた頃より全体的に収入が急に減ってる（これは奥さんも医師で大変人気があり患者が多かったことと、近年の不況で経済的に受診することが困難になり受診回数が減った患者が半数いることと、ジェネリックに半分かえたことで一人あたりの単価が減ったことによる）とかサラッとですが指摘されたらしく気になってしまいます。

税務署とはこと細かくチェックするようなので、これが当たり前なのでしょうか？特に気にすることではないのでしょうか？？
また調査はいつで完全に終了なのかご存じの方いらしたら、ご回答お願いいたします。
お恥ずかしい限りですが税務に関して全くの無知なので、分かりやすく説明していただけたら幸いです。
補足ですが、奥さんは突然亡くなられ、元来ずぼらな性格だった為、通帳の在りかもわからない状態で次々後から発見された物があり、修正申告も済ませました。

回答No.2

riffy13

遺産に関することなので問題は無いと思いますが、保険請求しておいて患者さん支払いぶん（３割とか）をもらわないのは違法です。
つけにしたりした分の処理をどうすればよいのか、保健所や支払い基金に確認したほうがいいです。
関係ない調査でそういうことがばれ、とんだやぶへびを喰らうこともあります。

回答No.1

tarin-0100

文章を読ませていただいた限りでは医業に対する税務調査では無く遺産相続に関してだと思います。どの医者もたたけばホコリが出ます。国保社保とガラス張りですから経費にならないモノを経費にしたり架空が有ったり　を彼達は知ってます。税務署はどこを叩くか（笑）とりあえず医業から　あれ？このオカネの出場所は？等と絡めて来ます。ずぼらな帳簿で有っても今の医者から取れるのはせいぜい片手（５００万）です。彼達は毎日貴院にかかりっきりではないのですよ。税務署員が二人来て２ヶ月経過と言っても、この二ヶ月彼達は毎日あなたの所にかかり切りでは有りません。せいぜい週一回か二回　つまり貴院に関してはまだ４～8回くらい調べていれば良い方です。遺産相続にどこから切り込むか　を狙っているんだと思います。私も過去さんざん税務署に入
られてその都度痛い目にあってきました。今でも懲りずに飲み食いを経費にして　バレもとと営業していますのであなたの気持ちは良く分かります。　心配無い　心配無い！！！！！