cDNAライブラリーのスクリーニング

質問

このときに必要な条件で
1.スクリーニングするときに何らかの既知の情報が必要
2.保存性の高いところをスクリーニング
と、あるのですが、まだ、学び始めたばかりで、良く分からなくて困ってます。

回答No.1

noname#53364 · ベストアンサー

スクリーニングについてはこちらを
http://www.mic.med.tohoku.ac.jp/98april/98april1/biology/screening1.html

１．何らかの既知の情報とは、ｃDNAのライブラリーからつってくるわけですから、DNAやら、アミノ酸配列やらがないとプローブが出来ないわけです。

保存性の高いところというのは、１とも関連しますが、既にいくつかの別種で配列がオープンになっていて、自分がとりたい種でとる場合（カウンターパート）、もしくは、アイソフォームの情報が分かっている場合はそこを狙います。いくつかの種で保存性が高いものであれば、今からとろうとするものでも同じ＝保存されている可能性が高いからです。（そんなに特殊な用語は用いていないので適宜調べてください）

他にも、オーバーラップの少ないコドンを使うとか、コドンの使用頻度の話とか、ハイブリの条件（温度等）をかえるやら出てくると思いますが、考え方はそんなに難しいものではないですので、多々発売されている本をごらんになられてはどうかと思います。

お礼

ありがとうございます。
これで何とかなりそうです