耳鼻手の質問はよく見かけますが、
レジストリを必要とするアプリケーションは、インストールが必須なので単純な移行はできないです。
ただ、アプリケーションによっては設定情報を
C:\Documents and Settings\アカウント\Application Data
や
C:\Documents and Settings\アカウント\Local Settings\Application Data
へ残しているものがあり、これも移行することで設定が戻る場合が多いです。
隠しフォルダを表示させてバックアップして下さい。
http://121ware.com/qasearch/1007/app/nec.jsp?002632