自分のデータを保存するディレクトリの構造はどうされていますか？
私のコンピュータには今までＣドライブしかなかったので、自分で作成したウェブサイトのプログラム等も含め全てのデータはＣドライブのマイドキュメントに保存していました。
今回、データ保存用にＤドライブ（Ｃドライブのハードディスクとは別の内蔵ハードディスク）を増設したのですが、どのようなディレクトリ構造にするか迷っています。
OS：Windows XP
PCは私一人で使用しており、共有はしていません。
以下は私が悩んでいる点ですが、アドバイス等いただけると幸いです。
問題点１：
現在Ｃドライブにあるマイドキュメントを以下の方法でＤドライブに移動するべきか？
http://support.microsoft.com/kb/310147/ja
問題点２：
とにかく自分で作成したウェブサイトのプログラム等は容量が大きくなりすぎているので、Ｄドライブに移動する必要があるのですが、これらの自作プログラムを、Ｄドライブのマイドキュメント内に「自作プログラム」などのフォルダを作成して、その中に格納するべきか？または、Ｄドライブの直下（マイドキュメント内ではなく）に「自作プログラム」などのフォルダを作成して、その中に格納するべきか？←この自作プログラムを格納する場所に関して一番悩んでいます。
問題点３：
そもそもマイドキュメントはどのような用途のファイル又はフォルダを保存するための場所なのか？自作のプログラム、Word&Excellドキュメント、インターネットからダウンロードしたデータ（未解凍のソフトウェア、画像、プログラム等）も全てマイドキュメントに保存するべきなのか？もしも全てマイドキュメントに保存するべきでないなら、どのようなデータをマイドキュメントに保存し、その他のデータはどこにどのように保存するのが良いのか？
その他にも良いアイデアがあれば、お聞かせください。
皆さんは、コンピュータの自分のデータ（ＯＳのデータではなく）を保存するディレクトリの構造はどうされていますか？
ＰＣの自分のデータ（ＯＳのデータではなく）を保存するディレクトリ構造を考える上で参考になるサイト等ありましたら教えてください。
よろしくお願いします。
補足
Windows XPです。 接続は、プライマリ スレーブ セカンダリーマスター＆スレーブに S-ATAとＩＤＥです。 外付けではないので、取り外しは不可です。よろしくお願いします。