折りたたみに限らず、分解して運ぶ際にも袋は必須です。
輪行袋という名称で自転車屋に行けば売っています。
なお、ローカル私鉄などでは、たたまずにそのまま持ちこむことが認められている路線もあります(近鉄養老線の一部列車や熊本電鉄など)が、これは、サイクリストへの便宜と言うより、生活者への配慮です。
なお、自転車を袋に入れてあると言っても、トレンクルやストライダのような特殊な小径車をのぞけば、ラッシュでは非常識なくらいの大きさになりますから、気づかないと言うことはないと思います。あと、気づきにくいのは、輪行するものが気を遣って、時間帯をずらす、端の車両やデッキなどに自転車をおいているなどしているからかも知れません。知りあいにトライアスロンやっているのがいますが、レースに持ちこむときはかなり気を遣っているようです。
なお、市販されている低価格の折りたたみ車は車に積むならともかく、持ち歩くには重すぎるし、たたんだ状態で持ちやすいように出来ていませんから、それもあるでしょう。
私のような世代だと、輪行というと思い描くのはランドナーベースでフロントフォークの抜けるモデルですね。
補足
ありがとうございます。 >トレンクルやストライダのような特殊な小径車を >輪行するものが気を遣って、時間帯をずらす 条件がととのえば例えば、 *自宅からA駅まで自転車で *A駅からB駅まで輪行で *B駅から会社まで自転車で というような通勤スタイルは、かのうなのでしょうか?