Windows Vista/7に Microsoft Office 2007をインストールすると、言語バーが Microsoft Office IME 2007に変わりますが、Windows 標準の Microsoft IMEと2種類のIMEが存在することになります。
Officeアプリケーションやメモ帳などは、Office IME 2007の辞書が反映されますが、IEにはMicrosoft IMEの辞書しか反映されません。
つまり、2つのIMEにある単語登録用の辞書は別物になっているということで、必要なIMEの辞書のほうに登録する必要があります。
片方に登録したものをテキストで出力して、もう一方に追加してやれば済むのですが、使用するアプリによって使い分けが必要になってくるわけです。
Windows 7 単語登録
http://rcdrifttt01.blog34.fc2.com/blog-entry-552.html
下記はVistaの例ですが、7でも同様です。
Vistaの IE7 で MS-IME のユーザー辞書を使いたい
http://snow-white.cocolog-nifty.com/first/2007/05/vista_ie_7_msim_f800.html
補足
なんと・・・ こんな厄介なシステムになっていたとは・・・ ありがとうございます! 修正しますね しかし、こんな厄介なことしなくても、 と思ってしまいましたw