OSのインストールをするときは
biosでCD/DVDの起動順序を先頭にして保存終了し
CDから起動しなければいけません。
OSが起動した状態でインストールしたのではありませんか?
またはCDから起動しても
Press any key to boot from CD
と画面に表示されたときに見逃してキーを押さずに
HDDが起動しているとか。
CDから起動し
Press any key to boot from CD
と画面に表示されたらすかさずenterキーを押して
CDからインストールを始めて
新規インストールを選択してフォーマットも行えば解決すると思います。