順番ではこうなっていると思います。
（↑古い↓新しい）
＜FILEシリーズ＞
単行本全27巻
＜Caseシリーズ＞
魔犬の森の殺人
銀幕の殺人鬼
天草財宝伝説殺人事件 上下巻
雪影村殺人事件
露西亜人形殺人事件 上下巻
怪奇サーカスの殺人
金田一少年の決死行 上下巻
＜Short Fileシリーズ＞
短編集1巻
短編集2巻
短編集3巻
短編集4巻
短編集5巻
短編集6巻
＜Akechi Fileシリーズ＞
明智少年の華麗なる事件簿
明智警視の優雅なる事件簿
＜新シリーズ＞
吸血鬼（ヴァンパイア）伝説殺人事件
オペラ座館・第三の殺人
獄門塾殺人事件
雪霊伝説殺人事件
ちなみに、「Short Fileシリーズ」と「Akechi Fileシリーズ」は
サイズが単行本とは違い、大きめ（ワイド版？）になっています。
「Short File、Akechi Fileシリーズ」と「Caseシリーズ」は発行順番が逆かもしれません。
ちょっと忘れてしまいました。
「講談社漫画文庫版」と文庫でもでているようなので
今から集めるとしたら文庫の方が冊数が少なくて収納にいいかもしれませんね。
ただし、「新シリーズ」は文庫に含まれていないと思いますので
新シリーズは単行本で集めたらいいと思います。
ちなみに私は文庫ではないもので全巻集めましたので文庫はどんなものかわかりません。
