ネットカフェのパソコンで、この回答を書いています。
１．ネットカフェには、会員制のところ非会員制のところがあり（非会員制は相当大きな都市の都市部に多いようです。都市部にも会員制の店もあります、念のため）、会員制のところですと初回利用時に会員証を作る必要があります。会員証作成時に身分証明書（免許証等）が通常必要です。入会料が必要です。非会員制の場合は、名前等を紙に書くことになっている場合が多いようです。なお、店の入口もしくは受付に説明や料金表があると思いますので、確認できると思いますが、受付で確認することも可能です（確認のために店に入りたくない場合は、電話すれば教えてもらえるはずです）。
２．利用時間を選択します。ほとんどの店では通常料金プランの他に、３時間プラン等一定の時間プランがあります（通常料金で同じ時間を利用するより、いくらか割安です）。まれに、自動的に清算時に、客に有利な料金プランを自動選択してくれる店がありますが、少数派のようです。
３．店から席を示されます。複数種類の席（テレビのみのシートや、リクライニングシート等）がある場合は、種類については選択ができます（私が今使用している店は席の選択も可能です）。
４．入店時間を書かれたものが渡されますので、なくさないように。ほとんどの店では、料金生産時に必要です。
５．店から指定された席につきます。フリードリンク制の場合は、席に着く前にドリンクをとった方が時間の節約でしょう。なお、ネットカフェでも実質的には漫画喫茶でもあることが多いですので、読みたい漫画を持っていくのも良いかもしれません。
６．インターネットは自宅等のパソコンと同様に使えます（店にあるパソコン機種にもよりますが）。yahooメール、gooメール等インターネット上からフリーメールを出すことも可能です。
７．料金支払いは、前払制・後払制両方があるようです。数としては後払制が多いようです。店を出るときに入店時に渡された紙等を受付に示します。個人的には、遅くとも退店時間の３分前までには退店手続きが終わるつもりで動くことがお勧めです。
料金は、店によって違います。私が今使っている店のものを参考に示します（地方都市の店です）。私が住んでいる地域でもこの料金より高い店も安い店も両方存在します。
・通常料金 ３０分まで２５０円 以後１５分毎１００円加算
・３時間プラン １０００円
・６時間プラン １７００円
何ができるかは、店によって違います。ネットカフェであれば、インターネットは最低でも可能なはずです。また、多くの場合、漫画は読めると思います。漫画がある場合は、他の人が呼んでいない限り、特に著名な週間少年誌（週間少年ジャンプ・週間少年チャンピオン・週間少年マガジン・週間少年サンデー）は間違いなく読めるはずです。
お礼
大変丁寧な回答をして頂き、ありがとうございました！ また、ネットカフェでの貴重な時間を私の質問の回答に当てて頂き、感謝します！ 細かなところまで良く分かり、本当に参考になりました！ 料金もさほどではなさそうなので、早速利用してみようと思います！