まず…MozillaActiveXControlを導入してて表示エンジンを切り替えて使っている場合、表示エンジンがGeckoになったりしてませんか?可能性薄いと思うけど。
そうでないならここまでのやり取りを見る限り、全く原因が不明な感じです。Sleionirのコンポーネンツが一部破損してしまったとか、そんな感じがします。
万策尽きた感じなら、一度Sleipnirを再インストールしてみてはどうですか?案外これで解決するかも知れません。
exe形式のインストーラーを使ったなら『プログラムの追加と削除』からアンインストールし、再度インストール。
通常はSleipnir.exeが入ってるフォルダの中にuser\<あなたのユーザー名> フォルダがあってそこに設定ファイルが入ってるので、事前にそのフォルダをコピーしてどこか適当な場所にバックアップしておき、インストール後Sleipnirフォルダに戻せば良いかと。
zip形式の配布ファイルを解凍して使ってるなら、デスクトップとか適当な場所に新たに解凍した中から、設定ファイル以外のファイルを全て上書きする、と。
動作のおかしくなったアプリケーションがインストールしなおすことで正常になったと言う経験、当方でも幾つかあります。
あとはベータ版使ってるなら正式版にしてみるとか、過去のバージョン取ってあるならそれに戻してみるとか。
その場合、Favorite.sfv以外のファイルは引き継がずに再度設定し直す方が良いと思います。
補足
ご回答ありがとうございます。 IE上での設定はどのように行えば良いのでしょうか? IEで検索したのですが、いまいち設定ができているか分からない状態です。 すいませんが、よろしくお願いします。