＞内臓のドライブ(C,D)のうちDにwin8の回復パーテーションが保存されています
Dドライブにパーティションは保存はできないのでwin8のイメージバックアップではないでしょうか、又は回復パーテーションのデータですか？
イメージバックアップは容量もそれなりにとるので内蔵HDDの容量が問題になります、イメージバックアップからの回復はHDDを初期化して書き込むので普通は別のHDD（内蔵、外付け等）に取ります。
＞現状でWindowsのリフレッシュを行うとWin8まで戻ってしまいます
Win8.1のイメージバックアップがあればWin8.1の初期状態になります。
Win8.1のイメージバックアップをDドライブに取るとCドライブの容量によりますがWin8のそれとは別に作られますが、復帰させる場合オプションでCドライブを初期化して復帰しますので間違うと同じHDDの場合エラー（HDD全体を初期化、これが普通の処理です）になる可能性があります。
＞もしくはこの回復パを使わずにUSBメモリ等にWin8.1(10)の回復パを作成しそれを利用してPCのリフレッシュを行うことはできるのでしょうか？
"回復パーティション"は意味が違うので適切な表現ではありません、メーカーPCは専用パーティションを持ちそこに回復処理のできる領域がありそれで工場出荷状態に戻すのが一般的です。
実際にやったことはありませんがWin8のイメージバックアップをUSBメモリーに移動して新たにWin8.1のイメージバックアップを作ります、これならリフレッシュしてもWin8.1の初期状態に戻ります、USBメモリーも数10GB必要になることもあります。
Win8,Win8.1,Win10のイメージバックアップは別に作られますので上書きはありませんが容量はかなりになります、Cドライブにデータがあればその全てを含みます。
できれば別のHDDを用意してイメージバックアップを作ることを薦めます、回復ポイントについては違うものなので間違わないように、IT用語についても正しく理解しないと意図が正しく伝わりません。
貴方の意図と違っている可能性もあるのであくまで参考程度にしてください。
