大雑把に言うと艦娘のレアリティは図鑑画面の背景色で区分けされています。
青→銀→金→ホロ(虹色?)って感じですね。青やホロの中にも細かな内訳がありますが割愛します
基本的に青くらいなら必要になった時に拾いに行ってもいいくらいでしょうかね
銀や金もステージが進んで来ればダブつくようになり
運がよかったり、プレイ期間が長くなればホロ背景も次第にダブるようになります。
というわけで、さしあたって必要ないと思うものであれば改修に使っちゃっていいんじゃないでしょうかね
ただし、今日現在で武蔵、伊401、伊19の3隻は再入手の方法が存在していません。
また大和や大鳳などは途方もない資源が必要になってきますので
その辺は慎重に考えたほうがいいでしょうね(ここらをいらないと思えるのはやめる人くらいでしょうけど)