お気に入りは
「マイコンピュータ」-「Cドライブ(OSのインストールされているドライブ)」-「Documents and Settings」-「(普段使用しているユーザー名)」-「お気に入り」のなかにあるものをすべてコピーして別媒体に入れておき、あとで同じ場所に入れ直せばOKです。
E-MAILはメーラーによって保存方法が違うので
あまり具体的には示せませんが、
メーラーのインストール先を特に変更していないのであれば
普通はCドライブのProgram Filesにインストールされているはずですので、
そこからとりあえずフォルダをまるっとコピーし、
新しく取り替えたHDDに同じメーラーをインストールします。
ここからちょっとコツがいるのですが、
フォルダの中をのぞいて個々のメールっぽいやつを新しいHDDの方のフォルダへ入れます。
それでメールが見えるようになればいいですが、
たぶんダメなので同じところに入っている設定ファイルっぽいやつも
いっしょに入れてみたりして、
元に戻るまで試行錯誤を繰り返してみてください。
元データがとってあるんで失敗しても大丈夫のはずです。
ちなみに一般的にはメールアカウントのフォルダがあって、
その中に個々のアカウントのメールが保存されていると思いますが‥。
フォルダの名前とかで予想しながらやってみるとけっこううまくいったりします。