純正品のスピーカーに付いている物はパワーアンプです。純正品の場合ヘッドユニットにはパワーアンプが内蔵されてなく、フロント用リア用ともに独立したパワーアンプを持っています。ヘッドユニットが社外とのことですが、ヘッドユニットは直接スピーカー出力があるタイプでしょうか？もし直接スピーカーを接続するタイプであれば、純正品のパワーアンプは不要ですので、パワーアンプのコネクター及びパワーアンプ～スピーカー間の配線を外し、ヘッドユニットからの配線を直接スピーカーへ接続すればＯＫです。このタイプのヘッドユニットの出力をパワーアンプの入力に接続すると過大入力により、パワーアンプやスピーカーを破壊する可能性がありますので、避けなければなりません。スピーカー本体のテストはスピーカーとアンプを接続していた配線を外し、スピーカーに乾電池をつなぎボツ・ボツというような音が出ればとりあえず、ボイスコイルは断線していないことが確認できます。また、上記の方法でラジカセなどのヘッドホン出力をつないでも確認（ただし音が小さい）できます。
上記の処理をする場合、すべてのスピーカーに対して同じ様にすることが必要です。即ち、スピーカーが４本ある場合、各スピーカーに２本ずつ配線を引く必要があります。また、スピーカーの極性とヘッドユニットの極性をすべてそろえる必要があります。ヘッドユニット側ではプラグの形状（通常メス側が＋）をそろえれば良く、スピーカー側は端子部に表記があるはずです。これをそろえないと音質（特に低音域）が劣化します。
お礼
良回答は期待していなかったのですが、専門家ってすごいですね １２０％の回答ありがとうございました。