貼られている画像の様が状態に出会ったことが無いので詳細はわからないですね。
試しに当方のPCでローカルネットワーク(ワークグループ)で動作確認してみましたが共有元でフォルダのアイコンを変更するとネットワーク越しで見た場合もその変更したアイコンがフォルダのアイコンとして表示されますね。
ただし「%SystemRoot%\system32\SHELL32.dll」で選んだアイコンだけで例えば共有元のPCにしか無いアイコンファイルを指定した場合はネットワーク越しで見ても通常のフォルダアイコンとして表示されました。
その背景が黒くなったフォルダを開いてその中にある「desktop.ini」を削除したり内容を書き換えてみるのはどうでしょうね。
補足
回答ありがとうござい