ご質問のような状況では、航空会社からの補償は原則としてないと思います。
天候・気象条件による欠航は、航空会社の責任ではないので、よくて翌日便に振り替えてもらえますが最悪「お食事券」です。空港ビルの中での飲食がタダになるというものですが、2000円までとか制限があったような。
ですので旅行代理店が6400円返すといっているのであれば、まだましな方ではないでしょうか？
私は台風のために行きの航空便が欠航し、旅程全部が変わってしまったことがあります。
パックツアーではなく個人で購入しましたが、旅行代理店を通した格安料金でした。ですからノーマルチケットではなく、質問者さんと同じく「ツアー」扱いになります。
幸い、翌日の同便に無料で搭乗することはできました。（約款上はこの権利すらないそうですが、国際線の場合は温情で乗せてくれるケースが多いらしい）
さらにずうずうしく、乗り継ぎ便と到着地のホテル全てキャンセルすることになるが、何らかのサポートを得られないか？と「相談」してみましたところ、到着地のカウンターにFAXで連絡を入れてくれ、翌日のホテルを無料でゲットすることができました。予定のよりは低いランクでしたが。
この場合、国際線で、なおかつ搭乗前に交渉したため約款を超えたサービスを受けられたのではと理解しています。
それでも、空港までの往復運賃や宿泊予定だったホテルのキャンセルチャージ等は自腹でした。しかも10日ほどの旅程全部が変わってしまったため、実質的にはかなりの赤字でした。
天候はいたしかたないのでしょうね。
長くなりましたがご参考になれば幸いです。
