エンディング直前までプレイしているところです。
攻略サイト等すみずみまで読んでいる訳じゃないので、確実なことは言えませんが、致命的なものはないです。
今まで気づいた中では「大蛇の抜け殻」(モブのお礼でもらえる)は、途中のイベントで持っているともらえる品物が良くなるようですね。私は知らずに売り飛ばしましたが、まあ良くなるといってもショップで買える商品なので問題はありません。
それと「黒の珠」は置いておくと、あとで使うチャンスがあるようです。これもまた集めれば良いだけなので、売っても問題ありません。
ということで、テレポストーンとギザールの野菜以外は売ってしまっても良いでしょう。