１） OS ・・・ （こわれることありますか？）
Windowsと異なり、基本的にユーザーが手を加えることのできない領域に指定されていますので、root化などの改変作業を行わない限りはまず壊れることはありません。
ただし、メーカーが独自にカスタマイズした部分に不具合や脆弱性があった場合は別ですけど。
頻繁に取り沙汰されるウィルスアプリも、この仕様の為に基幹部分への影響を与えることは不可能。また、その実行もサンドボックスという仮想領域内に限られていますので、アンインストールで簡単に除去できます。
２） OSの設定も保存できますか？
上述した通り、OSのシステム部分には手を加えることができない（どころか、通常ではシステム部分をエクスプローラで表示させることすらできない）ので、そこに格納されている設定をバクアップすることは不可能。
仮にアプリを用いるにしても、これもまた上述の通り動作がその制限下ですので、出来ません。
３） 電話の設定（アドレスBOOK ）
連絡先等は、Googleアカウントに同期させることで保存することが出来ます。
デフォルトで同期の設定になってるはずですが、端末設定の「同期」から同期させたいアカウントを選択し、連絡先…だったと思います。
これで、オールリセット後も同じGoogleアカウントを設定すれば、勝手に復元しておいてくれます。
４） アプリとその設定
システムアプリ以外のアプリ（マーケットからダウンロードしたもので、プロテクトされていないもの）は可能。ただし、アプリごとの設定は設定がSDカードに保存される仕様か、アプリに設定のエクスポート（出力）・インポート（入力）機能がなければ無理です。
root化されていればシステムアプリも含む全てのアプリとその設定がバックアップ可能ですが、そもそもよくわからない人にroot化自体をお薦めしません。
他にも、各メーカーや端末ごとに専用のバックアップソフトが付属されていたりしますので、そちらを利用するという手もありますが、あまり期待しないほうが良いでしょう。
お礼
そうですか、現在、OSの開発元である、googleのアカウントに同期していますが、その他特に必要ないようですね。 回答ありがとうございます。 OSがROMされ、これにより改変を防止されているというわけですか。 現在、無料のウィルス対策ソフトとサービスに付属しているDOCOMOのメールスキャンを導入しています。当方の使い方としては、root化などは想定しておりません。というか、rootでLOGONする必要を感じません。 回答ありがとうございます。