世田谷区できちんとアンテナの方向が合っていればよほどの事がない限りMXもTV東京も映るはずです。
そもそもの状態でMX/TV東京が映らなかった、ということは見た目上のアンテナの方向は合っていても実際にはTV受信できるレベルの信号が入力されていない、ということになります。
他のchが映っていたのはTVチューナーの能力の下限ぎりぎりのところで受信できていた可能性が高いでしょう。
スカイツリーの方向を向いている、とのことですが、現状まだスカイツリーからは電波が送信されていませんので、東京タワーの方向へアンテナを向ける必要があります。
世田谷のどこか、にもよりますが、東京タワー方向はほぼ真東、スカイツリー方向は東北東ですね。
以下の内容を確認してみてください。
・アンテナの向いている先(先端側)に建物等、見通しを遮るものはありませんか?
→地デジの信号(UHF)は光と似たような性質を持っています。たとえアンテナが正しい方向を向いていたとしてもアンテナと東京タワーの間に大きな建物等があり邪魔をしている場合には正常に受信できません。
仮に近くのアンテナと同じ方向を向いていたとしても、受信できない可能性は大です。
(屋根上設置の場合でも、屋根の右端では受けられず、左端では受けられる、等の場合もあります)
・電波の強さはどれぐらいですか?
→テレビの設定画面で受信信号の強度を測ることができます。
説明書にも書かれていると思いますが、この信号強度が一定以上ないと正常に受信できません。
たぶんこの信号強度が必要下限値を下回っているので受信できないのだと思われます。
どちらにせよ、アンテナの向きと高さを変えてみてください。
それでダメであれば、プロのアンテナ業者を呼んで調整してもらうしかないですね。
以上、ご参考まで。