単純なことですが、それ以外にも多くの不具合が出ます。
> ユーザーフォルダをHDDに移動させました
これが原因なだけです。
ユーザフォルダを勝手に移動してはいけません。
Windows の仕様に拘わることで、ハードウェアには関係ありませんから
自作でなくても同じです。
そのまま書き戻せば、*多分* 不具合はなくなるはずですが、
もしも途中でナニかしていたら、ただ書き戻しただけでは
また不整合が起きてしまいます。
後者の場合は、再度クリーンインストールしとくのが得策です。
OS がインストールした状態は、ユーザが勝手に手作業で
移動等を行ってはいけません。
SSD の容量不足は、その他のアプリケーションソフトの導入先や
テンポラリの作成先などを HDD に設定することで回避しましょう。
SSD の書き込みは 読み込みほどには早くないのが一般的ですから。
補足
一度、移動させたデスクトップのフォルダを、 もとあった場所に戻しところ、警告はなくなりました。 今回、フォルダを移動させたのは、 SSDの場合、書き込み回数によって性能の低下などがあると、 ネットや雑誌に書いてあったため、フォルダを移行させました。 そのため、現在一時もとあった場所に戻しましたが、 警告を消す方法が他にあるようであれば、 またSSDの方からHDDに移動させたいと考えております。