1.お気に入りに登録した件数が非常に多く、探すのが大変
2.削除せずに放置しておくのに少なからず差しさわりがある。
・・・・という点が質問の背景にあると思われます。
削除の仕方は、おそらくご存知と思われます。
更新日時から判断して絞り込むのはいかがでしょうか。
見つけやすくなると思います。
[お気に入り]のメニューをクリックして、キーボードのSHIFTキーを押しながら[お気に入りの整理]をクリックします。
そうすると、お気に入りフォルダがMyDocumentと同様のウィンドウで開くので、そこで、詳細表示にし更新日時で並べ替えをします。
また、フォルダが複数あって探しづらいのであれば、
上部にある[検索]ボタンをクリックし、[ファイルとフォルダすべて]を指定、[いつ変更されましたか?]のところで更新日時を指定して検索します。
変更後の名前の一部でも覚えていれば、キーワードによる検索も有力な選択肢となります。