インストール時にレジストリに何も書き込まないアプリケーションなら大丈夫・・・と思ったらそれもオオマチガイで、不具合が発生することが多々あります。
たとえば、プログラム単体で動作するアプリケーションでも、ファイルを右クリック→「プログラムから開く」でそのアプリケーションを参照させてしまった場合、その時点で「HKU\固有のID\Software\Classes\Applications 以下にそのアプリケーションのパスを含むキーが登録されてしまいますが、このエントリは「プログラムから開く」ダイアログの「参照」ボタン経由で移動先のアプリケーションを指定しなおしたところで、修正されることはありませんから、結局「プログラムから開く」経由でそのアプリケーションを使用することがでけへんようになります。
修復には、該当キーを削除するなどのレジストリの直接編集が必要になってしまいます。
また、動作設定をレジストリではなく、*.iniファイルで管理している場合は当然そのiniファイルの書き換えが必要になるとお考えになったほうがいいですし、NAVなどの大型アプリになると、インストール情報がレジストリだけではなく、別途バイナリファイルとしてこっそり記録保存されていて、こうなるともはやシロウトが扱える範疇を大きく越えちゃいます。
補足
ドライブのインストールプログラムを貯めているフォルダをリネームしたいのですが、可能ですか? 無理なような気がしますが・・・ 念のため教えてもらえますか。