Windowsを起動させたいということでしょうか？
それとも起動しないPCのデータをフロッピーに移したいということでしょうか？
前者の場合はOSを再インストールされるしかないと思います。
WindowsXPや2000でしたら修復セットアップというものが
あるのですが、Windows98ですともう一度OSを入れ直すしかありません。
リカバリCDがあればスムーズに購入した当時と同じ状態に戻すことが
出来るのですが、Windows98の通常版になってしまうと、そのPCに
接続してあるデバイスのドライバをインストールする必要があります。
この作業が少々知識が必要になってしまいますので、頑張って
リカバリCDを見付けて下さい。もしくは、PC購入時にメーカーへ
ユーザー登録をしているのでしたら、有償になってしまいますが
リカバリCDを購入出来るメーカーが多いです。
後者の場合は起動ディスクで起動した後にDOSコマンドで
ファイルをコピーする必要があります。こちらはMS-DOSを
お使いになったことが無い人にはかなり難しい作業になると思います。
基本的にDOS/V機でしたらHDDはCドライブになっています（NECの場合は
Aドライブの物もありますが・・・）。Cドライブからcopyコマンドで
必要なファイルをコピーしていく地道な作業が必要になります。
また、漢字のファイル名を指定してコピーしたい場合には、
config.sysにFEP（漢字を使えるようにするプログラム）を
ロードするように書き込む必要が出てきてしまい、
かなり難しい作業になります（ワイルドカードを上手く使えば
漢字のファイルもコピー出来ますが・・・）。
