Windows XP PROならば、
鍵を掛けたい「フォルダ」で右クリックします。
プロパティを選択します。
全般タブの下段の詳細設定をクリックします。
詳細設定のタブの一番下の「内容を暗号化してセキュリティで保護する」にチェックマークを付けます。
自分以外の人は開くことができなくなります。
（大事なことですが）ファイルを暗号化するだけでなくこのHDDを他のPCに接続してもこのHDDを第三者は開くことができません。
有料のソフトが沢山ありますが、フォルダに鍵をかけてもHDDを挿げ替えて内容を表示される（暗号化されているかもしれませんが）こともありますので、XPのほうが優っていることもあります。
